目前制造业中ERP的“被替代化”愈趋明显。这是MES与ERP本质差异的必然结果。
ERP的本质为企业宏观层面的管理，属于计划层，多从资源规划与财务角度出发，是为了解决企业的“糊涂账”。底层数据得不到及时有效反馈;组织之间的众多信息盲点，ERP并不能很好兼顾。
而MES从制造本身出发，更关注制造执行，解决的不再是计划与进销存的问题，而是整个系统如何智能化。提高生产效率与产品质量、实现优排产、做到零库存等以达到精益生产的目的。以手抓杯子作比，人们既需眼睛的视觉功能，还需大脑判断发送指定，最后还需要手的协调。眼、大脑、手缺一不可。MES就是这样一个集成化的一体化的制造执行系统。
另外，ERP多为通用版本，高度标准化，不分行业，选择性小。随着制造业发展，ERP已越来越难满足制造企业个性化需求，企业新添加的生产环节难以嵌入，产生信息模糊地带。而MES标准化与个性化模块的自由组合及即插即用特性将很好解决这一问题。性价比也更高。
这一替代程将从中小企业开始。因为相对而言，中小企业接受度更高，替换也更为容易，成本也更低。大企业存在固定思维与利益的博弈，决策时间长，短时间替换ERP还有一定难度。但得益于中高层教育与观念的改变，这一现象有可能在十年内改观——实际上，一些电力集团已开始向MES迈进。
