质量管理作为MES系统一个非常重要的功能，通过SPC、SQC分析质量问题的源头，在根源处消除隐患。全面的质量管理从原材料的检验、加工过程控制、质量检验与改进到产品质量总结，都能实现质量数据与信息的实时展现与共享。生产管理人员可以查阅实时的质量数据，及时查找和分析结果背后的原因，第一时间给出解决对策。
MES质量管理采用计算机自动编码和条码提取并检验相关的质检信息，制定相应的质量管理流程，实现原材料供应商的评估和选择，并对采购的原辅材料进行抽样检验，严格控制采购品的质量。这样既保证了IQC过程的安全、可靠性，提升产品制造过程中的良品率。
MES系统的质量管理功能包括：质量标准管理、过程质量控制、检测数据采集、质量统计分析、质量指标考核等功能。
MES质量的过程管理模块作为MES系统的核心功能，由统计分析过程(SPC)负责生产过程的一切管理。而SPC由statistical(统计)、process(过程)、control(控制)构成，其中statistical(统计)以数理统计为基础，基于数据的科学分析和管理方法，识别企业生产过程中的变差，从而消除特殊原因引起的各种问题。process(过程)负责生产的输入和输出活动。control(控制)通过掌握规律来预测未来的发展并实现预防。
MES质量检验可以通过多种手段取得实际的数据，而质量检验的结果要依据产品技术标准和相关的文件或检验规程的规定进行对比，确定每项产品质量的特性是否合格，从而对单件或者整个批次的质量进行判定。质量的改进则是通过对质量检验提供的数据进行汇总、分析、制定措施，从根本上解决已出现或将要出现的问题, 使产品从设计、制造、服务到满足顾客要求, 达到一个新水平。
产品质量总结，质量统计报表是生产过程中不可或缺的一种质量管理的统计方式，根据MES系统中存储的生产流程中的质量信息数据，利用参数统计、概率分布、和数据挖掘等多种统计手段进行质量分析，挖掘产品质量与各种参数之间的规律，并以各种图形表现出来。提供生产过程中原材料、半成品、报废品进行月报、季报、年报。
全面的质量管理作为MES系统中的重要模块，既要完成生产过程的跟踪，也要负责和ERP进行对接，实现生产过程中的数据共享。
效率科技MES质量管理模块，实现了制造业务和质量管控过程的自然融合，确保了质量活动与制造过程的完美交互，系统中的质量管控、质量分析等模块对自动采集得到的海量数据进行筛选、分析与反馈控制，形成数字化为特征的企业车间质量管理体系，能够有效提高质量管理活动的执行效率，并使制造过程的质量反应能力和质量控制能力得到极大的提高。
